Perbedaan Peptidoglikan dan Pseudopeptidoglikan:
| No. | Peptidoglikan | Pseudopeptidoglikan |
| 1 | Biasa disebut dengan Murein. | Biasa disebut Pseudomurein. |
| 2 | Ditemukan di dinding sel Bakteri. | Ditemukan di dinding sel Archaebacteria. |
| 3 | Blok pembangun karbohidrat adalah N- Asetilglukosamin (NAG) dan N- asetilmuramat (NAM). | Blok pembangun karbohidrat adalah N-asetilglukosamin (NAG) dan N-asetiltalosaminuronikasid (NAT). |
| 4 | Satuan karbohidrat individu dihubungkan oleh ikatan glikosidik β 1 – 4. | Satuan karbohidrat individu dihubungkan oleh ikatan glikosidik β 1 – 3. |
| 5 | Link silang peptida mengandung asam amino D dan L. | Link silang peptida hanya mengandung asam amino L. |
| 6 | Urutan asam amino dari ikatan silang peptida adalah L – Alanina, D – Glutamin, L – Lisin dan D – Alanine * | Urutan asam amino dari ikatan silang peptida adalah L – Glutamin, L – alanin, L – Lisin dan L – Glutamin * |
| 7 | Dinding sel mungkin mengandung asam Diaminopimelik (DAP), analog struktural dan turunan dari Lysine | Asam diaminopimelik benar-benar tidak ada dan tidak dilaporkan di dinding sel Archaebacteria |
| 8 | Antibiotik seperti Vankomisin dan Penicillin dapat menurunkan dinding sel peptidoglikan. | Vankomisin dan Penisilin tidak peka terhadap pseudopeptidoglikan dan mereka tidak dapat menurunkannya. |
| 9 | Peptidoglikan sensitif terhadap aktivitas enzim lisozim. | Pseudopeptidoglikan tidak sensitif terhadap aktivitas enzim lisozim. |
* Grup yang berbeda dapat menunjukkan variasi. Urutan ini adalah yang paling umum.